57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2156 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  72.41 
 
 		 63 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  74.14 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  72.41 
 
 		 63 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  74.07 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  74.07 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  68.52 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  65.52 
 
 		 59 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  67.24 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  67.24 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  66.67 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  65.52 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  66.67 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  59.65 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  58.93 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  57.14 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  56.9 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  57.14 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  57.14 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  57.14 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  53.57 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  53.57 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  51.79 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  53.57 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  50.85 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  53.57 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  52.83 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  59.26 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  51.79 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  57.41 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  50 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  46.55 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  47.17 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  45.28 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  40.38 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  48.15 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  47.17 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  49.02 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  44.44 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  43.4 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  45.1 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  47.92 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  40 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  40.38 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  43.4 
 
 		 56 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  45.1 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  47.06 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  45.1 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  45.1 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  41.67 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  41.51 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  43.86 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  42 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  38.46 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.14 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  38.46 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>