39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1332 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  100 
 
 		 60 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  71.67 
 
 		 60 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  62.5 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  60.71 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  64.29 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  64.29 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  64.29 
 
 		 59 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  60.71 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  58.93 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  64.15 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  64.15 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  50.85 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  60.38 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  53.57 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  58.49 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  58.49 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  53.45 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  53.57 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  48.21 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  51.79 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  48.28 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  54.72 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  51.85 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  44.83 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  44.83 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  48.21 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  40.74 
 
 		 59 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  47.17 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  47.17 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  48.21 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  44.64 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  46.43 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  44.64 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  46 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  40 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  40 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>