53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5381 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  71.64 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  71.64 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  74.6 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  74.6 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  74.6 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  71.64 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  73.02 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  73.02 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  70.15 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  66.67 
 
 		 63 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  63.49 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  73.21 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  65.57 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  73.21 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  71.43 
 
 		 59 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  65.57 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  66.07 
 
 		 59 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  62.3 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  59.65 
 
 		 59 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  53.52 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  53.97 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  49.3 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  49.21 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  62 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  62.26 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  52.83 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  47.54 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  54.72 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  44.44 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  41.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  42.86 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  38.46 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  46.27 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  46.3 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  38.71 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  42.59 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  38.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  44.64 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  43.14 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  47.83 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  43.14 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  31.75 
 
 		 65 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  43.14 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  46.94 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  41.18 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  43.14 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  43.14 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  41.18 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  37.93 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1305  CsbD family protein  45.65 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  35.59 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>