29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0545 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  55.56 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  44.07 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  51.85 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  53.85 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  46.27 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  50.85 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  50.85 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  50.85 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  53.85 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  44.83 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  50.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  50.85 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  55.32 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  50.88 
 
 		 63 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  46.55 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  46 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  51.92 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  47.92 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  44.83 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.78 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  51.92 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  45.9 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  43.1 
 
 		 63 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  44.26 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>