61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2060 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  100 
 
 		 61 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  64.29 
 
 		 61 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  49.09 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  49.09 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  59.32 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  45.45 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  57.63 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  47.27 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  52.54 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  50.85 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  50.85 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  52.63 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  45.76 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  49.12 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  38.98 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  46.55 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  50.94 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  55.1 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  41.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  45.61 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  53.19 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  45.45 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  43.64 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  50 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  45.45 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  44.07 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  49.09 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  46.15 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  38.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  37.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  38.98 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  37.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  46 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  46.81 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  43.64 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  38.98 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  40.68 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  46.81 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.4 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  38.89 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  47.92 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  43.64 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  45.45 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>