118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3983 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  95.65 
 
 
70 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  95.65 
 
 
70 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  95.65 
 
 
70 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  95.65 
 
 
70 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  95.65 
 
 
69 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  92.75 
 
 
69 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  89.86 
 
 
69 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  82.61 
 
 
69 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  76.81 
 
 
69 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  72.31 
 
 
77 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  67.69 
 
 
73 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  66.15 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  66.15 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  61.54 
 
 
72 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  65.22 
 
 
79 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  67.16 
 
 
67 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  61.54 
 
 
73 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  65.67 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  68.25 
 
 
66 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  62.32 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0312  CsbD family protein  60 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  68.85 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  66.13 
 
 
67 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  70.49 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  62.12 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  68.85 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  56.72 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  64.52 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  65.57 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  63.93 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  64.52 
 
 
72 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  57.97 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  59.42 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  65.52 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  55.22 
 
 
67 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  66.13 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  59.38 
 
 
70 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  66.67 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  57.14 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  55.38 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  53.73 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  56.06 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  56.52 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  62.07 
 
 
63 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  60.94 
 
 
69 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  53.85 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  56.45 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  53.85 
 
 
65 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  60.32 
 
 
68 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  56.45 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  59.02 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  59.02 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  56.45 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  56.45 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  54.84 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  53.85 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  54.69 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  54.69 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  57.38 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  58.62 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  48.44 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  58.62 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  55.38 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  55.17 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  49.18 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0274  CsbD-like protein  53.45 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0152084  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  50 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  49.18 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1268  CsbD-like  57.14 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2928  CsbD family protein  45.9 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1270  hypothetical protein  45.9 
 
 
74 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.390747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  44.26 
 
 
61 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  50 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  60.42 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1040  hypothetical protein  49.18 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2262  CsbD family protein  45 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.860427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  51.85 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  46.55 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  45.9 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  39.34 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  43.33 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  42.59 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  38.24 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1931  CsbD family protein  41.07 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.403244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3584  hypothetical protein  42.11 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0418  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.03 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.992162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0554  hypothetical protein  38.6 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  45.28 
 
 
63 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0456  hypothetical protein  38.6 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.503316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  45.28 
 
 
63 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  43.33 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>