35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1353 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  100 
 
 		 71 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  92.96 
 
 		 71 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  65.52 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  65.52 
 
 		 59 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  60.34 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  56.36 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  41.54 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  39.29 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  54.17 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  53.19 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  41.18 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  44 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  39.58 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  35.38 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  48.98 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  41.82 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  37.7 
 
 		 65 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  46 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  43.86 
 
 		 63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  47.62 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  39.58 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  48.98 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  48.98 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  46.94 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  46.94 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  45.65 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  45.65 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  45.65 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  30.16 
 
 		 67 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  45.65 
 
 		 101 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>