44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3114 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  52.54 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  47.46 
 
 		 59 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  43.86 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  50 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  47.92 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  51.02 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  50 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  48.98 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  46.15 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  46 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  45.83 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  44.9 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  41.82 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  44.9 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  44.68 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  41.82 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  46.94 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  47.27 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  42 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  43.14 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  40.82 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  39.22 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  44.44 
 
 		 71 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  47.83 
 
 		 63 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>