117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1219 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  100 
 
 		 72 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  54.39 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  51.79 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  48.21 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  52.73 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  45.76 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  49.21 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  49.09 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  49.09 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  40.68 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  45.45 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  41.38 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  43.64 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  41.07 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  49.06 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  49.06 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  43.4 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  48.15 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.64 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  41.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  42.19 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  36.67 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  42.11 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  46.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  48.08 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  48.08 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  41.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  37.29 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  38.46 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  45.28 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  48.98 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  44.44 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  45.28 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  47.73 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  34.48 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  40 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  38.18 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  36.21 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40.35 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  49.06 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  40.74 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  49.06 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  38.6 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  40.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  40.35 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  41.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  40 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  42.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  46.15 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  42.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  43.64 
 
 		 61 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  44.23 
 
 		 69 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  38.18 
 
 		 68 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  44.23 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  35.71 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  38.98 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>