15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0452 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  94.92 
 
 		 59 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  65.52 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  63.79 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  40.68 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  39.66 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  39.66 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  46.81 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  39.22 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  40.74 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  39.22 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  46.81 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>