78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5578 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  91.38 
 
 		 58 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  77.59 
 
 		 58 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  52.73 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  49.09 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  45.45 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  46.15 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  39.29 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  43.64 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  37.1 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  37.5 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  37.5 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  40 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  38.6 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  39.29 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  36.36 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  36.21 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  40.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  34.48 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  41.07 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  38.18 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  40.38 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  34.48 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  36.07 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  38.6 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  34.55 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  39.29 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  41.07 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  33.33 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  35.71 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  39.29 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  39.66 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  41.38 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  34.55 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  35.09 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  34.55 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  36.21 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  42.59 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  31.58 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  38.46 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  37.74 
 
 		 71 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  41.51 
 
 		 68 aa  40.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  42.31 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  36.84 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  41.51 
 
 		 68 aa  40.8  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  36.54 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  31.88 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.19 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  34.62 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  32.26 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  36.54 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  36.84 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  38.18 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  34.62 
 
 		 62 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  26.32 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  34.62 
 
 		 62 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>