42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2135 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  263  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  98.55 
 
 		 138 aa  262  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  87.68 
 
 		 138 aa  234  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  47.83 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0740  CsbD family protein  52.63 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  48.12 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  45.26 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  45.86 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  42.11 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  35.09 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  35.09 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  29.71 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  29.71 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  28.99 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  36.51 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  38.18 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  38.18 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  36.76 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  25.74 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  38.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  39.29 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  30.22 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  35.09 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  38.46 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  34.48 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  25.74 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  32.73 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  39.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  34.55 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  37.04 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  36.54 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  28.07 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  35.29 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  40 
 
 		 69 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  35.71 
 
 		 61 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>