70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5380 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  58.27 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  56.49 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  51.18 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  51.18 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  40.6 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  52.78 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  51.39 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0740  CsbD family protein  35.07 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  37.5 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  36.67 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  37.29 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  30.28 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  34.43 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  40.68 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  36.99 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  35.59 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  33.93 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  40.74 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  33.93 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  37.5 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  35.48 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  36.36 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  29.2 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  37.29 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  35.59 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  42.59 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  30.83 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  29.27 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  29.2 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  32.71 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  34.67 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  35.8 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  31.2 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  31.78 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  35 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  37.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  37.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  33.87 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  35.71 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  38.18 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  41.82 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  36.51 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  42.37 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  33.9 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  33.9 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  30.16 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  35.19 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  35.85 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  31.58 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  34.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  34.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  34.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  34.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>