36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2001 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  100 
 
 
82 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  44.44 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  42.86 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  39.74 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  39.24 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  37.33 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  36.71 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  34.18 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  35.44 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  43.14 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  28.57 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3006  putative general stress response protein  32.18 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.652543  normal  0.570216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  33.33 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  40.74 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  35.85 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  35.09 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  38 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1759  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.91 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  32.76 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  30.48 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  37.5 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1706  hypothetical protein  32.1 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  38.89 
 
 
127 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  28.04 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  37.04 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  38.89 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  38.89 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  37.93 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  35.85 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  37.5 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  37.5 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  33.93 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  36.54 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  29.63 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  28.7 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>