56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4729 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  100 
 
 		 118 aa  228  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  98.31 
 
 		 118 aa  225  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  94.92 
 
 		 118 aa  220  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  61.6 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  57.89 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  57.89 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  61.02 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  56.14 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  51.75 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  47.57 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  51.46 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  49.51 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  49.51 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40.17 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  39.41 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  39.41 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  38.84 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  33.87 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  34.4 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  46.77 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  47.37 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  40.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  40.68 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  39.34 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  39.66 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.29 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  40.68 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  38.33 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  37.18 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  37.7 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  36.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  37.7 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  29.03 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  32.14 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  36.07 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  42.11 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  31.78 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  36.07 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  38.78 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  43.64 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  28.07 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  35.59 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  33.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  34.15 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  28.07 
 
 		 61 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  39.29 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  42.86 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  37.29 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  34.15 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  32.86 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  38.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  37.5 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  27.87 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4163  hypothetical protein  36.92 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  34.92 
 
 		 71 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>