63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1539 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  100 
 
 		 120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  69.17 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  48.28 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  48.28 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  46.55 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  41.73 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  46.67 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  40.52 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  52.7 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  51.32 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  51.32 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  40.5 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  50 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  38.84 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  38.84 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  36.51 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  36.21 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  42.31 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  36.92 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  32.12 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  32.12 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  43.4 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  44.64 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  34.15 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  36.92 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  43.4 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  39.62 
 
 		 57 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  40 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  37.93 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  40.38 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  40.38 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  41.51 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  30.83 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  55 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  45.28 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  32.31 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  42.86 
 
 		 56 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  40.38 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  41.94 
 
 		 90 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  39.58 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  42.31 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  38.46 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  37.5 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  30.53 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>