60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5383 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  100 
 
 		 114 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  72.97 
 
 		 113 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  71.82 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  71.82 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  61.6 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  63.56 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  61.02 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  60.17 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  66.36 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  51.2 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  51.2 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  64.65 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  64.65 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  65.49 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  64.65 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  44.55 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  46.67 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  43.9 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  37.6 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  43.86 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40 
 
 		 74 aa  48.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  43.64 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  41.94 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  44.64 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  37.93 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.93 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  27.59 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.93 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  40.68 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  40.74 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4163  hypothetical protein  36.92 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  38.98 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  33.87 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  36.36 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  34.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  38.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  43.86 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  36.21 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  40.74 
 
 		 63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  32.73 
 
 		 61 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  36.36 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.14 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  34.48 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  29.69 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  38.89 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  42.11 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  32.73 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  41.67 
 
 		 64 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>