66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0395 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  100 
 
 		 113 aa  222  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  99.12 
 
 		 124 aa  219  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  81.42 
 
 		 113 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  69.91 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  71.82 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  69.03 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  68 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  68 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  68 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  59.65 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  57.85 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  57.89 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  57.02 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  46.63 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  46.63 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  46.79 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  48.28 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  44.64 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  42.62 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  33.06 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  27.47 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40.68 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  47.27 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0184  hypothetical protein  45.9 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  41.27 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  40.32 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  38.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  37.7 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  42.11 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  29.2 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  41.07 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  41.07 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  32.81 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  42.86 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  32.79 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  36.67 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  43.4 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  36.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  40.68 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  26.47 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  40.32 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  36.67 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  37.29 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  32.86 
 
 		 73 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  33.33 
 
 		 65 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  38.98 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  30.28 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  41.51 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  31.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  39.29 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  37.31 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  27.87 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  35 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  45 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  36.62 
 
 		 113 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>