56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2126 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  98.36 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  100 
 
 		 61 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  54.24 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2337  hypothetical protein  96.97 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.042061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  53.57 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  53.33 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  54.39 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  50.85 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  47.37 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  43.64 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  35.09 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  35.09 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  40.98 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  40.98 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  35.09 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.82 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  32.2 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  50 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  32.2 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  30.51 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  33.93 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.11 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  44.44 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  36.54 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  31.58 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  38.6 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  38.18 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  42.59 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  38 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  42.31 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  35.09 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  38.46 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  41.07 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  40.74 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  38.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  28.07 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  28.07 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  38.78 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  42.59 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  37.7 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  40.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  40.68 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  35.19 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  37.04 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>