75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2645 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  100 
 
 		 61 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  73.77 
 
 		 61 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  71.93 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  56.9 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  61.4 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  57.38 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  56.9 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  57.89 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  47.37 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  47.37 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  55.17 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  50 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  51.72 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  50 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  50 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  46.55 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  40 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  41.82 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  37.7 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  39.34 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  43.64 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  39.34 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  39.34 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  39.66 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  38.98 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  40 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.38 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  37.93 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  43.64 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  37.7 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  39.66 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  37.7 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  46.3 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  39.34 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  39.29 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  47.37 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  37.5 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  36.07 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  34.55 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  45.61 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  39.66 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  36.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  35.09 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  37.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40.35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  32.79 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  37.29 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  43.1 
 
 		 63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  34.55 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  41.38 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  36.36 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  36.36 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  37.93 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  37.93 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  34.55 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  35 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  35 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  32.79 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  31.15 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  34.48 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>