41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1879 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  100 
 
 		 62 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  100 
 
 		 62 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  70.97 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  72.73 
 
 		 57 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  65.57 
 
 		 63 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  65.57 
 
 		 63 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  52.54 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  50.85 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  41.82 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  41.82 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  37.1 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  51.79 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  40.98 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  37.29 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  40.98 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  45.45 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  40 
 
 		 68 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.59 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0165  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  44.64 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  35 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  46.67 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  35 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  40.68 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  33.9 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  41.07 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4802  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903489  normal  0.0852969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  41.51 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  45.1 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  40 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  34.62 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  40.82 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  34.55 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  42.86 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  34.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  34.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>