27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1855 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  100 
 
 
68 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  100 
 
 
68 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  98.53 
 
 
68 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  58.82 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  41.27 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  41.82 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  41.82 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.89 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  39.34 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  36.84 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  39.34 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  42.31 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  40 
 
 
131 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  40.38 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  36.36 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  42.31 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  39.62 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  37.29 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  42.86 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  38.89 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  44.64 
 
 
65 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  41.51 
 
 
67 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  41.51 
 
 
67 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  41.51 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  45.28 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  42.59 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0127575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>