39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1786 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  100 
 
 
70 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  58.82 
 
 
68 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  58.82 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  58.82 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  46.15 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  46.43 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  43.64 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  45.45 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  45.45 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  36.84 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  36.84 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  43.64 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  43.4 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  38.71 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  50 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  35.71 
 
 
58 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  35.71 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  35.71 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  39.62 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  37.7 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  48.08 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  44.23 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  41.67 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  35.09 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  39.29 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  38.6 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  33.93 
 
 
58 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  31.75 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  35.71 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  42.31 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  43.64 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  44.23 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  36.84 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  40.74 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  38.18 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  31.58 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  46.15 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  46.15 
 
 
71 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>