77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5153 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  100 
 
 
63 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  79.03 
 
 
63 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  77.42 
 
 
63 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  74.19 
 
 
63 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  74.19 
 
 
63 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  74.19 
 
 
63 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  56.67 
 
 
60 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  46.97 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  41.27 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  47.27 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  47.27 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  37.1 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  43.86 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  45.61 
 
 
57 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  42.11 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  45.45 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  48.08 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  38.98 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  44.64 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  45.45 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40.35 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  38.98 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  41.82 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  38.18 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  43.75 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  43.64 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  38.6 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  39.29 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  41.82 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  44.23 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  42.11 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  39.29 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  42.37 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40 
 
 
72 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  34.48 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  41.51 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  31.67 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  36.21 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  29.03 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  40.38 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  41.51 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  43.4 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  43.4 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  39.58 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  43.4 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  34.38 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  39.58 
 
 
72 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  42 
 
 
67 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  31.75 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  38.46 
 
 
59 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  35.59 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  37.93 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  29.23 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  38 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  41.51 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  40.3 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  43.75 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  31.58 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  38 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  36.54 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  38 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03506  hypothetical protein  54.55 
 
 
45 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  40.38 
 
 
69 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>