17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4611 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  49.33 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1706  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  40.51 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  42.86 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3006  putative general stress response protein  34.83 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.652543  normal  0.570216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  41.82 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  45.28 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  41.67 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  28.07 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>