40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0833 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  147  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  44 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  52.63 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  40.51 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  57.14 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  44.07 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  43.1 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  43.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  49.06 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  47.17 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  47.06 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  35.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  40.35 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  35.48 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  43.4 
 
 		 69 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  37.5 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  37.74 
 
 		 60 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  37.7 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.1 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  47.06 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  47.06 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  35.85 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  41.51 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1317  hypothetical protein  37.88 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.121882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  25.33 
 
 		 131 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>