56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  100 
 
 		 57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  66.67 
 
 		 57 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  67.86 
 
 		 58 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  64.91 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  61.4 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  60.71 
 
 		 56 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  59.65 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  60.71 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  62.5 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  57.89 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  59.65 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  56.14 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  54.39 
 
 		 57 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  54.39 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  55.56 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  55.77 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  54.39 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  50.88 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  54.72 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  41.07 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  44.64 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  54.72 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  55.77 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  55.77 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  45.45 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  55.77 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  45.61 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  43.64 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  65.71 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  40.38 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  46.43 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  53.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  40.35 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  52 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  47.17 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  50 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  40.38 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  43.4 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  52.38 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  52.38 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>