33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0494 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  78.69 
 
 		 64 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  78.69 
 
 		 64 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  71.43 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  71.43 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  48.21 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  48.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  45.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  43.14 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  45.1 
 
 		 70 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  50 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  42.11 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  50 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  38.71 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  42.86 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>