42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0195 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  100 
 
 		 57 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  66.67 
 
 		 57 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  66.07 
 
 		 58 aa  74.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  63.16 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  66.07 
 
 		 58 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  62.5 
 
 		 58 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  62.5 
 
 		 56 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  57.89 
 
 		 57 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  57.89 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  57.14 
 
 		 57 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  57.14 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  57.69 
 
 		 56 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  56.14 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  50.91 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  54.39 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  54.39 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  52.63 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  50 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  56.6 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  54.39 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  52.73 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  50.88 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  50.88 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  56.6 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  53.85 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  53.85 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  53.85 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  48.21 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  47.27 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  41.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  38.6 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  42.11 
 
 		 64 aa  47.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  42.86 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  47.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  41.51 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  51.11 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  38.78 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  44.23 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  44.23 
 
 		 63 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>