10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4149 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  36.9 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  36.73 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  44.9 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2617  CsbD family protein  38.78 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  38.78 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  35.09 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  42.86 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  36.92 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>