52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2686 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  100 
 
 		 98 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  55.1 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  46.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  31.96 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  52.73 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  52.73 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  47.17 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2617  CsbD family protein  41.84 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  49.09 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  42.86 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  43.75 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  55.32 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  50 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  42.67 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  42.19 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  42.86 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  48.15 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  42.19 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  47.27 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  42.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  44.83 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  47.27 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  46.3 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  46.3 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  53.19 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  43.64 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  42.86 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  43.4 
 
 		 67 aa  42  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  42.31 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  38.46 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  42.19 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  42.19 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  38.46 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  38.46 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  40.74 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  40.35 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  38.18 
 
 		 58 aa  40.8  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 790 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  48.98 
 
 		 63 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  36.54 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  41.07 
 
 		 57 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>