16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0619 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  120  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  84.85 
 
 
66 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  52.46 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  43.75 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  57.41 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1317  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.121882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  45 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  45.31 
 
 
71 aa  47  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  44.44 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  46.3 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  43.64 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  43.64 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  44.44 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  44.44 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  37.5 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>