More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3497 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3497  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 335 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.747121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  32.39 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  31.3 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  30.77 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0737  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2026  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  40.23 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  44.09 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.82 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  35.92 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6432  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  41.3 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>