252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0602 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0602  chromosomal segregation and condensation protein A  100 
 
 
278 aa  541  1e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl550  chromosomal segregation/condensation protein  40.58 
 
 
277 aa  208  7e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000452065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  27.57 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.64 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  27.73 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  27.73 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  27.31 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  29.63 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.15 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  27.2 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  27.8 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  27.8 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  27.2 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.89 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.43 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.73 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.05 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  25.71 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  26.67 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.05 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  24.37 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.67 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  26.89 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  25.21 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.46 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  25.2 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  26.42 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf010  segregation and condensation protein A  30.31 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.37 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  26.05 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.46 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  23.79 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.74 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.56 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.31 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  27.34 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.64 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  26.05 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1867  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.62 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00662232  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.96 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.24 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  26.45 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  23.43 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  23.43 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  26.27 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.89 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  33.64 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.63 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.94 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  25.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.43 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.24 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  24.9 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.23 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.54 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.6 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  24.58 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  26.23 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  25.73 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1725  putative Segregation and condensation protein A  32.23 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.608158  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  34.71 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.99 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  42.35 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  25.82 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.29 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  24.6 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.11 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  25.63 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.21 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2181  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.86 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  23.85 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  33.63 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.93 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  23.43 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.97 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  25.68 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.19 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.19 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.43 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  25.62 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.69 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  23.85 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.37 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.02 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>