252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1467 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  100 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  42.75 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.27 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  41.8 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  41.39 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.53 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  44.4 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  39.75 
 
 		 263 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  39.75 
 
 		 263 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.34 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.62 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.85 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  40.91 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.45 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.39 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  42.39 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  40.15 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.5 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.57 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  40.62 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  39.39 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.06 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  41.6 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  41.39 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.91 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.79 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.02 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.17 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  39.6 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.06 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  36.21 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  41.13 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.13 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  39.69 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 301 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  36.21 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.68 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  36.21 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  41.77 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  40.73 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  36.21 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  41.2 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.18 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.56 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  40.32 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.51 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.4 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  37.89 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.34 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  41.15 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.21 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.21 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  38.67 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.55 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.4 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.4 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  39.6 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  38.43 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.2 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.16 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.78 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  38.93 
 
 		 293 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  39.42 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  42.15 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  40.89 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  37.3 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  39.82 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  36.73 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  40.09 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  33.93 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  34.84 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  32.64 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  33.93 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  32.64 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  33.19 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  33.19 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>