206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0711 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 315 aa  642    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  29.79 
 
 		 289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  31.95 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  31.95 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  26.71 
 
 		 673 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  26.71 
 
 		 673 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  26.71 
 
 		 673 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 659 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 659 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 660 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.17 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  26.77 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  25 
 
 		 671 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  26.43 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 673 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.46 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.07 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.5 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.99 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.99 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.5 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  28.44 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  28.44 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.24 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.24 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.05 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 1001 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.04 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  22.98 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.84 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  22.32 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  21.84 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  24.19 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 510 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 417 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  21.91 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  30.57 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.26 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  22.71 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  22.71 
 
 		 672 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  22.71 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  22.71 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  22.71 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  22.71 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  21.37 
 
 		 697 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 		 626 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  28.43 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  22.11 
 
 		 724 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 		 712 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 		 712 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  22.51 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.45 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.25 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>