285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1843 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
706 aa  1382    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  48.31 
 
 
672 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  45.89 
 
 
671 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  47.91 
 
 
684 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  46.62 
 
 
694 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  47.33 
 
 
684 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  42.07 
 
 
717 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  34.53 
 
 
718 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  35.58 
 
 
757 aa  266  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  35.12 
 
 
739 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.99 
 
 
858 aa  262  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  35.79 
 
 
762 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  35.49 
 
 
755 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  36.1 
 
 
726 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  35.29 
 
 
764 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 
764 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  35.37 
 
 
799 aa  238  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.97 
 
 
674 aa  238  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  34.45 
 
 
752 aa  237  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  34.35 
 
 
778 aa  237  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  34.84 
 
 
752 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  35.25 
 
 
738 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  31.18 
 
 
843 aa  226  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  30.3 
 
 
757 aa  225  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  34.51 
 
 
774 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  30.92 
 
 
1007 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  31.65 
 
 
792 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  30.68 
 
 
810 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  34.29 
 
 
753 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  33.66 
 
 
719 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  25.5 
 
 
672 aa  210  9e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23.77 
 
 
720 aa  208  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  30.99 
 
 
788 aa  208  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  35.81 
 
 
754 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  35.37 
 
 
736 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  35.29 
 
 
702 aa  200  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  31.56 
 
 
760 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  31.62 
 
 
779 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  35.46 
 
 
714 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  37.47 
 
 
413 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  30.32 
 
 
697 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  36.6 
 
 
695 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  31.58 
 
 
760 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  27.64 
 
 
736 aa  148  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.93 
 
 
784 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
770 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.78 
 
 
815 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  30.81 
 
 
747 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.68 
 
 
797 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.69 
 
 
778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.67 
 
 
825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.43 
 
 
780 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 
799 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.59 
 
 
738 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.93 
 
 
840 aa  107  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 
835 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 
738 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.79 
 
 
773 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.49 
 
 
822 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.48 
 
 
757 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
773 aa  101  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.26 
 
 
802 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 
861 aa  97.8  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.63 
 
 
860 aa  97.8  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
840 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.9 
 
 
776 aa  97.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 
801 aa  97.4  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.49 
 
 
771 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.89 
 
 
773 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.12 
 
 
841 aa  94.4  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 
845 aa  94.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.88 
 
 
777 aa  94  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 
766 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.05 
 
 
818 aa  94  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.3 
 
 
737 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.84 
 
 
811 aa  91.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.73 
 
 
738 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.32 
 
 
759 aa  90.9  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  28.31 
 
 
750 aa  90.5  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
773 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 
761 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.74 
 
 
798 aa  89.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.73 
 
 
737 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.14 
 
 
896 aa  89.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.03 
 
 
773 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.8 
 
 
840 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.54 
 
 
738 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  23.47 
 
 
694 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25.29 
 
 
872 aa  87.8  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.96 
 
 
776 aa  87.4  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
808 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14730  DNA internalization-related competence protein ComA  29.86 
 
 
711 aa  84.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0603479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
740 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.07 
 
 
796 aa  84.7  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.04 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  25.57 
 
 
755 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.95 
 
 
789 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1611  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.37 
 
 
741 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804409  normal  0.12587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 
839 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>