282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1602 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
739 aa  1405    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  41.15 
 
 
718 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  41.34 
 
 
757 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  37.65 
 
 
672 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  36.74 
 
 
684 aa  291  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  36.68 
 
 
764 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  36.6 
 
 
684 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  38.17 
 
 
778 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  33.47 
 
 
792 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  38.69 
 
 
762 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  35.38 
 
 
697 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  36.25 
 
 
671 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  37.83 
 
 
706 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  38.76 
 
 
755 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  37.28 
 
 
764 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  26.43 
 
 
674 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  37.2 
 
 
774 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  38.62 
 
 
738 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.31 
 
 
720 aa  262  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  35.69 
 
 
858 aa  259  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  36.3 
 
 
752 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  36.27 
 
 
752 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  35.03 
 
 
799 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  30.5 
 
 
757 aa  243  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  35.64 
 
 
810 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  35.58 
 
 
726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  35.46 
 
 
694 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  30.88 
 
 
788 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  36.16 
 
 
695 aa  236  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  26.84 
 
 
672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  36.98 
 
 
760 aa  235  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  35.85 
 
 
754 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  36.23 
 
 
719 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  33.15 
 
 
779 aa  231  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  39.28 
 
 
736 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  34.96 
 
 
753 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  33.67 
 
 
843 aa  223  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.73 
 
 
717 aa  210  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  32.29 
 
 
1007 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  36.89 
 
 
714 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  32.74 
 
 
702 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  40.73 
 
 
413 aa  181  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  34.41 
 
 
760 aa  173  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  25.34 
 
 
736 aa  168  2.9999999999999998e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.17 
 
 
815 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.05 
 
 
840 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  31.29 
 
 
825 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.17 
 
 
797 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.29 
 
 
822 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
784 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.02 
 
 
835 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.8 
 
 
878 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.98 
 
 
780 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.82 
 
 
860 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  30.86 
 
 
747 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.39 
 
 
770 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.63 
 
 
860 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.29 
 
 
801 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.36 
 
 
839 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.61 
 
 
861 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.81 
 
 
773 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.37 
 
 
833 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.11 
 
 
766 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.14 
 
 
759 aa  99  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.67 
 
 
757 aa  97.4  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 
798 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.34 
 
 
796 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  30.37 
 
 
801 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  29.77 
 
 
795 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.77 
 
 
795 aa  95.1  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 
840 aa  95.1  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.42 
 
 
845 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.26 
 
 
771 aa  94.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.45 
 
 
772 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.38 
 
 
840 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.78 
 
 
776 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  31.19 
 
 
847 aa  91.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.94 
 
 
799 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.62 
 
 
808 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
948 aa  89  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
776 aa  88.2  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.64 
 
 
766 aa  87.8  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.89 
 
 
778 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.21 
 
 
738 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.31 
 
 
738 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.6 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.08 
 
 
740 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.66 
 
 
791 aa  84.3  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 
747 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.48 
 
 
832 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.76 
 
 
737 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
929 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.56 
 
 
846 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  27.62 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.95 
 
 
773 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.48 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.1 
 
 
841 aa  80.5  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.32 
 
 
802 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.11 
 
 
851 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 
819 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>