250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0927 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 694 aa  1414    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.32 
 
 		 708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  29.61 
 
 		 604 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.11 
 
 		 679 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  27.98 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  24.07 
 
 		 678 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  29.92 
 
 		 636 aa  190  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  28.77 
 
 		 593 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.41 
 
 		 757 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.4 
 
 		 786 aa  150  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  30.48 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 		 778 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.81 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.72 
 
 		 796 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.51 
 
 		 896 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.7 
 
 		 761 aa  118  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.1 
 
 		 795 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  29.17 
 
 		 755 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.79 
 
 		 795 aa  114  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  29.61 
 
 		 734 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  29.15 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.41 
 
 		 759 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.83 
 
 		 798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.08 
 
 		 791 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 		 840 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.58 
 
 		 674 aa  109  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.97 
 
 		 748 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.78 
 
 		 780 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  28.54 
 
 		 724 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  27.12 
 
 		 546 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  28.46 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.21 
 
 		 818 aa  104  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  26.82 
 
 		 672 aa  103  9e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  28.48 
 
 		 494 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  28.99 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.77 
 
 		 773 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.58 
 
 		 771 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.87 
 
 		 720 aa  99.8  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  25.83 
 
 		 454 aa  97.8  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.44 
 
 		 773 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 		 797 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  26.32 
 
 		 798 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  26.89 
 
 		 722 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  34.3 
 
 		 511 aa  95.1  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  27.14 
 
 		 816 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  24.01 
 
 		 879 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  26.4 
 
 		 734 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.26 
 
 		 773 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  25.82 
 
 		 728 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  28.99 
 
 		 759 aa  92  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 		 808 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 		 773 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  28.44 
 
 		 769 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  25.7 
 
 		 792 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  25.18 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 		 868 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  30.53 
 
 		 757 aa  89.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  25.3 
 
 		 718 aa  89  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.97 
 
 		 809 aa  88.6  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.29 
 
 		 752 aa  87.4  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  26.81 
 
 		 448 aa  87  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.59 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.89 
 
 		 682 aa  87  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25 
 
 		 735 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  28.46 
 
 		 872 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  27.16 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  27.53 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  22.66 
 
 		 684 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  29.62 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  24.11 
 
 		 717 aa  84.7  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  26.92 
 
 		 843 aa  84.3  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  31.48 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  31.28 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  26.02 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  25.61 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  24.68 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.95 
 
 		 775 aa  82  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.05 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 		 719 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  26.16 
 
 		 697 aa  81.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  23.08 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.27 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  23.92 
 
 		 735 aa  80.5  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  24.41 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.83 
 
 		 846 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  27.33 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  22.31 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  27.73 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.87 
 
 		 841 aa  78.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  27.16 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  23.92 
 
 		 872 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.53 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  29.15 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 		 749 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.12 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.05 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.05 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.05 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  24.9 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>