258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2030 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 760 aa  1481    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  50.36 
 
 		 714 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  46.09 
 
 		 719 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  33.84 
 
 		 718 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  32.63 
 
 		 764 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  32.93 
 
 		 774 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  32.48 
 
 		 671 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  31.44 
 
 		 755 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  32.22 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  33.49 
 
 		 764 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  32.14 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  31.92 
 
 		 757 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  32.72 
 
 		 684 aa  210  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  33.58 
 
 		 752 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  33.28 
 
 		 684 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  32.28 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  33.08 
 
 		 738 aa  205  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 		 752 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  30.58 
 
 		 706 aa  203  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  34.71 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  31.42 
 
 		 810 aa  187  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.8 
 
 		 720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  24.62 
 
 		 674 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  32.05 
 
 		 799 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  32.69 
 
 		 697 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 		 717 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  32.89 
 
 		 694 aa  181  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  32.22 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  29.29 
 
 		 792 aa  178  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  30.47 
 
 		 702 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  29.48 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  32.5 
 
 		 760 aa  171  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  25.19 
 
 		 672 aa  170  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  26.53 
 
 		 858 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  31.4 
 
 		 753 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  32.87 
 
 		 754 aa  167  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  37.25 
 
 		 695 aa  167  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  33.88 
 
 		 736 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1007 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  25.55 
 
 		 736 aa  160  6e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  29.49 
 
 		 779 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  34.17 
 
 		 413 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  28.52 
 
 		 843 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  28.61 
 
 		 757 aa  134  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  29.66 
 
 		 825 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.74 
 
 		 801 aa  111  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.9 
 
 		 822 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.06 
 
 		 798 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.75 
 
 		 835 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.5 
 
 		 778 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.32 
 
 		 766 aa  101  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 		 841 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 		 771 aa  98.2  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.03 
 
 		 815 aa  97.8  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  30.23 
 
 		 846 aa  97.4  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  27.07 
 
 		 754 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  27.87 
 
 		 754 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.55 
 
 		 784 aa  94.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  28.05 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  28.05 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  28.05 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.1 
 
 		 777 aa  94  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.48 
 
 		 757 aa  93.2  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.49 
 
 		 770 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  29.28 
 
 		 756 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  28.05 
 
 		 754 aa  92  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 		 794 aa  91.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.5 
 
 		 766 aa  91.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 		 797 aa  91.3  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  28.86 
 
 		 754 aa  90.9  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.66 
 
 		 747 aa  90.9  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.15 
 
 		 811 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.92 
 
 		 948 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.38 
 
 		 759 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  28.53 
 
 		 737 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.64 
 
 		 802 aa  88.2  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 		 773 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  28.53 
 
 		 737 aa  88.2  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.23 
 
 		 800 aa  87.8  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.17 
 
 		 878 aa  87.8  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.39 
 
 		 708 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.44 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.32 
 
 		 851 aa  84.7  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  28.23 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 832 aa  84.7  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.1 
 
 		 840 aa  84.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.79 
 
 		 839 aa  84.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  28.41 
 
 		 737 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.65 
 
 		 833 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  26.2 
 
 		 604 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.31 
 
 		 818 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  27.69 
 
 		 763 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  27.08 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.56 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.42 
 
 		 786 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.52 
 
 		 840 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.8 
 
 		 808 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>