251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1522 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  67.91 
 
 		 752 aa  806    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 736 aa  1387    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  70.31 
 
 		 753 aa  756    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  68.98 
 
 		 752 aa  799    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  69.44 
 
 		 760 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  81.21 
 
 		 738 aa  959    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  44.41 
 
 		 792 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  43.4 
 
 		 779 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  43.4 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  43.47 
 
 		 755 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  41.49 
 
 		 764 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  41.53 
 
 		 762 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  40.34 
 
 		 778 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  40.77 
 
 		 764 aa  350  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  39.38 
 
 		 757 aa  347  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  41.75 
 
 		 774 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  35.52 
 
 		 694 aa  292  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  36.94 
 
 		 672 aa  287  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  35.96 
 
 		 858 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  36.61 
 
 		 843 aa  275  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  38.02 
 
 		 739 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1007 aa  273  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  35.47 
 
 		 788 aa  270  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  34.65 
 
 		 671 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  34.26 
 
 		 810 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  36.08 
 
 		 799 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  34.4 
 
 		 706 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  35.27 
 
 		 684 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  35.83 
 
 		 754 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.69 
 
 		 720 aa  243  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  35.37 
 
 		 684 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  35.44 
 
 		 719 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.7 
 
 		 717 aa  237  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.08 
 
 		 674 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  37.73 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  29.14 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  32.54 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  44.04 
 
 		 413 aa  217  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  25.72 
 
 		 672 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  34.48 
 
 		 714 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  34.45 
 
 		 702 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  32.3 
 
 		 760 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  25.26 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  32.54 
 
 		 695 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.36 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.86 
 
 		 784 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.48 
 
 		 851 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.26 
 
 		 845 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.01 
 
 		 835 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 		 761 aa  99.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.67 
 
 		 797 aa  99  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.7 
 
 		 770 aa  98.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.87 
 
 		 860 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.87 
 
 		 818 aa  96.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.81 
 
 		 798 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.19 
 
 		 771 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  28.61 
 
 		 825 aa  94.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  28.95 
 
 		 846 aa  92  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.01 
 
 		 785 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.07 
 
 		 839 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.19 
 
 		 822 aa  89  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 		 801 aa  89  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.86 
 
 		 772 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.58 
 
 		 878 aa  88.6  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.27 
 
 		 773 aa  87.8  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.2 
 
 		 800 aa  87.4  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.63 
 
 		 747 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 		 840 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.48 
 
 		 757 aa  87  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  27.55 
 
 		 694 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 780 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.07 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.59 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.02 
 
 		 948 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.61 
 
 		 802 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.94 
 
 		 840 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.64 
 
 		 799 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.23 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 		 777 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 		 929 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.27 
 
 		 833 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.43 
 
 		 740 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.25 
 
 		 811 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  25.69 
 
 		 752 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.42 
 
 		 604 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.92 
 
 		 846 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.24 
 
 		 738 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  25.96 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  22.63 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  26.36 
 
 		 801 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.68 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.45 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.7 
 
 		 759 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.78 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0785  competence protein, ComEC  31.66 
 
 		 986 aa  74.7  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  25.6 
 
 		 700 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  22.13 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  26.41 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>