218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1679 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
779 aa  1510    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  65.81 
 
 
792 aa  911    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  41.54 
 
 
752 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  41.06 
 
 
752 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  43.4 
 
 
760 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  42.9 
 
 
753 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  43.77 
 
 
738 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  37.09 
 
 
762 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  42.15 
 
 
736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  36.91 
 
 
718 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  34.18 
 
 
778 aa  337  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  36.78 
 
 
764 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  36.13 
 
 
774 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  36.13 
 
 
764 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  37.03 
 
 
755 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  35.23 
 
 
757 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.05 
 
 
858 aa  266  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  32.89 
 
 
739 aa  250  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  32.77 
 
 
694 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  31.08 
 
 
788 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  32.85 
 
 
1007 aa  238  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  30.65 
 
 
672 aa  232  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  35.17 
 
 
810 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  33.85 
 
 
726 aa  227  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  32.57 
 
 
799 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  32.77 
 
 
671 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  29.86 
 
 
697 aa  226  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  29.49 
 
 
843 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  31.36 
 
 
706 aa  219  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  34.7 
 
 
754 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  38.89 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  25.39 
 
 
757 aa  213  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23.42 
 
 
720 aa  209  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  31.76 
 
 
684 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  32.1 
 
 
684 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  30.96 
 
 
719 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  29.72 
 
 
717 aa  190  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  31.79 
 
 
714 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  24.09 
 
 
674 aa  178  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  22.44 
 
 
736 aa  164  8.000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  23.27 
 
 
672 aa  147  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  30.41 
 
 
702 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  27.81 
 
 
695 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  29.49 
 
 
760 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.82 
 
 
815 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.28 
 
 
784 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 
770 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.55 
 
 
801 aa  90.9  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.7 
 
 
840 aa  89.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.16 
 
 
840 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.27 
 
 
847 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.32 
 
 
740 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.41 
 
 
802 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 
929 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.16 
 
 
839 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.5 
 
 
835 aa  83.2  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 
776 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.86 
 
 
845 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.78 
 
 
766 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25480  putative competence protein  33.11 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1443  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.11 
 
 
843 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.41 
 
 
797 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.57 
 
 
772 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.25 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
771 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
833 aa  74.7  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  31.25 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  28.33 
 
 
801 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.1 
 
 
812 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.57 
 
 
778 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.53 
 
 
798 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  24.75 
 
 
735 aa  72.4  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  31.07 
 
 
825 aa  72.8  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  26.98 
 
 
846 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 
841 aa  72  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1818  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.03 
 
 
765 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0856288  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.28 
 
 
738 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.18 
 
 
800 aa  70.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  26.92 
 
 
747 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  24.68 
 
 
735 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.69 
 
 
738 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.83 
 
 
851 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.7 
 
 
811 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.21 
 
 
840 aa  68.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.06 
 
 
794 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
736 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.11 
 
 
839 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.87 
 
 
738 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.77 
 
 
761 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  26.51 
 
 
689 aa  68.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.19 
 
 
819 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.37 
 
 
818 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.79 
 
 
880 aa  68.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.74 
 
 
822 aa  68.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.74 
 
 
737 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.7 
 
 
773 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.7 
 
 
773 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  27.13 
 
 
700 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 
747 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2021  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.09 
 
 
833 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.130557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>