278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2785 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
726 aa  1379    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  36.24 
 
 
718 aa  316  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  38.53 
 
 
757 aa  291  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  37.56 
 
 
684 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  36.64 
 
 
684 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  34.75 
 
 
672 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 
739 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  36.36 
 
 
706 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  35.55 
 
 
671 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  35.67 
 
 
694 aa  253  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  35.14 
 
 
755 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  35.69 
 
 
764 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 
717 aa  240  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  35.39 
 
 
762 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  34.74 
 
 
778 aa  237  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.79 
 
 
858 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  37.43 
 
 
738 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  35.24 
 
 
752 aa  228  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  32.28 
 
 
799 aa  228  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  35.34 
 
 
764 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  23.24 
 
 
674 aa  226  8e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  35.4 
 
 
752 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  34.08 
 
 
779 aa  223  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  32.78 
 
 
810 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  31.54 
 
 
792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  27.23 
 
 
757 aa  218  4e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  37.25 
 
 
736 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  32.41 
 
 
788 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  35.73 
 
 
760 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  34.89 
 
 
774 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  35.45 
 
 
719 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  34.81 
 
 
753 aa  206  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  32.12 
 
 
1007 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 
672 aa  204  4e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  30.69 
 
 
843 aa  200  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.53 
 
 
720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  32.47 
 
 
697 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  32.01 
 
 
702 aa  195  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  33.27 
 
 
754 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  36.27 
 
 
714 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  33.76 
 
 
695 aa  180  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  31.4 
 
 
760 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  33.67 
 
 
413 aa  142  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  27.3 
 
 
736 aa  126  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.66 
 
 
757 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.06 
 
 
759 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.78 
 
 
771 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  29.44 
 
 
879 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.34 
 
 
835 aa  97.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.64 
 
 
801 aa  95.1  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 
797 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.73 
 
 
818 aa  93.6  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.64 
 
 
798 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.39 
 
 
778 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  30.28 
 
 
825 aa  92.4  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 
841 aa  92.4  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.41 
 
 
777 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
840 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  29.69 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 
766 aa  88.2  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.14 
 
 
761 aa  88.2  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.37 
 
 
822 aa  87  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 
815 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  27.93 
 
 
689 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.14 
 
 
811 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  24.7 
 
 
708 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  28.94 
 
 
750 aa  85.5  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  23.36 
 
 
735 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.4 
 
 
749 aa  84  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.35 
 
 
772 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.34 
 
 
770 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  23.01 
 
 
735 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 
808 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.48 
 
 
773 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.14 
 
 
794 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.27 
 
 
752 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
773 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.79 
 
 
780 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.18 
 
 
804 aa  79  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.24 
 
 
840 aa  78.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.64 
 
 
773 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  21.3 
 
 
679 aa  77.4  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  24.35 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.06 
 
 
814 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.19 
 
 
784 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.13 
 
 
773 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.38 
 
 
861 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  28.77 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.05 
 
 
776 aa  74.3  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.17 
 
 
773 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.83 
 
 
800 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.73 
 
 
851 aa  73.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.61 
 
 
770 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  28.84 
 
 
784 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.4 
 
 
791 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.64 
 
 
837 aa  72  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0764  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.4 
 
 
811 aa  71.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.804759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  21.86 
 
 
604 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.13 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 
845 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>