283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1397 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
702 aa  1358    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  35.42 
 
 
672 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  35.51 
 
 
671 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  33.66 
 
 
757 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  35.81 
 
 
778 aa  241  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 
718 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  37.98 
 
 
755 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  35.88 
 
 
684 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  36.17 
 
 
764 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  30.22 
 
 
858 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.34 
 
 
717 aa  227  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  36.06 
 
 
774 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  35.54 
 
 
684 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  29.65 
 
 
757 aa  219  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  35.53 
 
 
706 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  34.79 
 
 
764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  35.91 
 
 
754 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  35.2 
 
 
694 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  31.8 
 
 
843 aa  215  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  35.94 
 
 
1007 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  30.27 
 
 
810 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  35.27 
 
 
799 aa  210  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  37.34 
 
 
762 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  32.98 
 
 
739 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  33.39 
 
 
726 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  30.67 
 
 
788 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  34.8 
 
 
752 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  35.38 
 
 
738 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  24.17 
 
 
674 aa  192  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  32.92 
 
 
697 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  34.63 
 
 
752 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  34.77 
 
 
753 aa  185  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  31.06 
 
 
792 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23 
 
 
720 aa  181  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  33.87 
 
 
714 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  34.13 
 
 
736 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  26.86 
 
 
672 aa  177  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  31.54 
 
 
719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  33.95 
 
 
760 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  30.08 
 
 
779 aa  161  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  32.71 
 
 
760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  24.21 
 
 
736 aa  146  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  34.13 
 
 
695 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.28 
 
 
815 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
784 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 
785 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  32.38 
 
 
825 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.4 
 
 
822 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.65 
 
 
878 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.32 
 
 
771 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.51 
 
 
841 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 
773 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.4 
 
 
757 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.07 
 
 
773 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.13 
 
 
777 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.92 
 
 
766 aa  96.3  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.2 
 
 
765 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
811 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 
766 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.81 
 
 
797 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.16 
 
 
773 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.46 
 
 
798 aa  94.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.14 
 
 
773 aa  94  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.93 
 
 
840 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  36.26 
 
 
413 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  28.91 
 
 
747 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.04 
 
 
778 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.58 
 
 
839 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.37 
 
 
773 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.48 
 
 
773 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105792  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.03 
 
 
812 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  28.37 
 
 
846 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  23.84 
 
 
735 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.14 
 
 
773 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.46 
 
 
799 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
802 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.94 
 
 
791 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.67 
 
 
845 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
840 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.55 
 
 
776 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.46 
 
 
860 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.97 
 
 
738 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1818  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.96 
 
 
765 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0856288  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.48 
 
 
840 aa  85.5  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2803  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.94 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.4 
 
 
861 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2148  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.48 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.16 
 
 
762 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.07 
 
 
761 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  35.56 
 
 
750 aa  84.7  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2827  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.82 
 
 
767 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0829289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.07 
 
 
773 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  24.15 
 
 
735 aa  84  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.46 
 
 
738 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.22 
 
 
847 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.16 
 
 
747 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1667  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.97 
 
 
795 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.86 
 
 
860 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  24.72 
 
 
733 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>