272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4370 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
757 aa  1465    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  43.85 
 
 
778 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  43.32 
 
 
774 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  41.81 
 
 
755 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  43.7 
 
 
762 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  42.28 
 
 
764 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  42.28 
 
 
764 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  38.4 
 
 
752 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  39.79 
 
 
752 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  39.4 
 
 
738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  34.03 
 
 
792 aa  324  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  36.57 
 
 
718 aa  311  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  38.66 
 
 
760 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  38.01 
 
 
753 aa  307  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  35.94 
 
 
788 aa  306  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  41.15 
 
 
739 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  34.46 
 
 
779 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  36.04 
 
 
672 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  33.67 
 
 
799 aa  282  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 
858 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  39.11 
 
 
736 aa  276  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  33.71 
 
 
810 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  38.11 
 
 
726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  36.21 
 
 
706 aa  266  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  29.44 
 
 
757 aa  263  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  35.74 
 
 
754 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.83 
 
 
720 aa  256  9e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  34.6 
 
 
1007 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  34.89 
 
 
684 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  31.47 
 
 
843 aa  250  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  34.75 
 
 
684 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  46.68 
 
 
413 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  32.88 
 
 
671 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  24.66 
 
 
674 aa  241  4e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  32.29 
 
 
697 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  36.55 
 
 
694 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  32.71 
 
 
702 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  26.07 
 
 
672 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  34.25 
 
 
719 aa  211  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 
717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  34.75 
 
 
714 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  24.69 
 
 
736 aa  177  5e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  32.75 
 
 
760 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  32.58 
 
 
695 aa  171  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.84 
 
 
815 aa  111  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.78 
 
 
784 aa  101  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.65 
 
 
770 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.5 
 
 
840 aa  100  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  33.33 
 
 
846 aa  99.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  29.71 
 
 
747 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.35 
 
 
845 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.44 
 
 
840 aa  97.4  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.96 
 
 
772 aa  95.5  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.97 
 
 
860 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
835 aa  95.9  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
861 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.79 
 
 
778 aa  91.3  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.93 
 
 
773 aa  90.9  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.65 
 
 
840 aa  90.9  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.63 
 
 
833 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.13 
 
 
801 aa  89.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.3 
 
 
851 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
839 aa  88.2  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.09 
 
 
780 aa  88.2  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
801 aa  88.2  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.29 
 
 
738 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.09 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
802 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.69 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  25.98 
 
 
735 aa  85.9  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
796 aa  85.9  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.86 
 
 
825 aa  85.9  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.9 
 
 
832 aa  85.5  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.62 
 
 
766 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.94 
 
 
818 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25.18 
 
 
735 aa  83.2  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.32 
 
 
878 aa  83.2  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 
757 aa  82.4  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  26.59 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.24 
 
 
929 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.09 
 
 
773 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  30.77 
 
 
694 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.68 
 
 
798 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  26.69 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.87 
 
 
841 aa  81.3  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.92 
 
 
860 aa  80.5  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.33 
 
 
797 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.58 
 
 
766 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.61 
 
 
880 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  32.1 
 
 
847 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
819 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  28.13 
 
 
754 aa  77.4  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.45 
 
 
773 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.02 
 
 
738 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.83 
 
 
737 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.61 
 
 
822 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  27.7 
 
 
801 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.48 
 
 
773 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.75 
 
 
747 aa  75.5  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>