259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4682 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 752 aa  1437    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  85.26 
 
 		 753 aa  1067    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  96.94 
 
 		 752 aa  1280    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  70.07 
 
 		 736 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  70.9 
 
 		 738 aa  792    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  70.67 
 
 		 760 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  43.99 
 
 		 792 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  41.14 
 
 		 779 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  41.2 
 
 		 755 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  40.94 
 
 		 762 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  40.67 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  38.66 
 
 		 778 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  39.95 
 
 		 764 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  39.63 
 
 		 764 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  40.03 
 
 		 757 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  38.3 
 
 		 774 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  36.14 
 
 		 858 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  34.44 
 
 		 788 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  35.69 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  35.55 
 
 		 694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  35.65 
 
 		 671 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  34.1 
 
 		 672 aa  262  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  31.94 
 
 		 810 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  34.09 
 
 		 706 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  35.5 
 
 		 739 aa  257  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.58 
 
 		 720 aa  240  5.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  36.41 
 
 		 684 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  36.41 
 
 		 684 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.81 
 
 		 717 aa  236  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  35.03 
 
 		 799 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  31.39 
 
 		 757 aa  233  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  25.97 
 
 		 674 aa  233  8.000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  31.47 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  35.11 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  33.49 
 
 		 719 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  43.33 
 
 		 413 aa  225  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  25.38 
 
 		 672 aa  210  9e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  30.49 
 
 		 697 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  33.68 
 
 		 760 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  24.71 
 
 		 736 aa  197  7e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  34.46 
 
 		 702 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  33 
 
 		 714 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  30.99 
 
 		 695 aa  157  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.56 
 
 		 845 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 		 784 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.02 
 
 		 797 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.32 
 
 		 772 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.79 
 
 		 860 aa  108  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.07 
 
 		 798 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.67 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.86 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.62 
 
 		 801 aa  104  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.34 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.93 
 
 		 773 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.79 
 
 		 851 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.96 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.05 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  27.85 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.83 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.19 
 
 		 840 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.42 
 
 		 840 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 		 839 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.79 
 
 		 800 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  29.55 
 
 		 825 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.63 
 
 		 835 aa  96.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.42 
 
 		 861 aa  94.7  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.93 
 
 		 802 aa  94.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.63 
 
 		 878 aa  94.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.21 
 
 		 948 aa  93.6  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.77 
 
 		 766 aa  93.2  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  25.06 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.4 
 
 		 822 aa  92  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.61 
 
 		 773 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  29.52 
 
 		 847 aa  90.9  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  24.49 
 
 		 735 aa  90.9  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.09 
 
 		 771 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.63 
 
 		 780 aa  90.1  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 777 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.82 
 
 		 736 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.36 
 
 		 799 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.81 
 
 		 738 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.42 
 
 		 811 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 		 833 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.28 
 
 		 757 aa  87.4  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  20.97 
 
 		 679 aa  87  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  29.71 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.07 
 
 		 766 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.06 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.8 
 
 		 785 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  28.47 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  23.71 
 
 		 755 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  26.13 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.53 
 
 		 737 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  30.72 
 
 		 750 aa  84  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.95 
 
 		 808 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.33 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.44 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.41 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1249  ComEC/Rec2-related protein  35.38 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>