More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15110 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  100 
 
 		 376 aa  772    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.14 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.08 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  35.85 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  35.02 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  30.53 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  35.62 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  35.5 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  31.19 
 
 		 473 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.47 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.33 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  27.89 
 
 		 379 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2293  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  26.72 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0695  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.45 
 
 		 313 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.73 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.1 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.23 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  29.67 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  30.48 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.74 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  41.9 
 
 		 128 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  27.73 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  53.52 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  53.52 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  53.52 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  53.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  35.92 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.64 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  54.93 
 
 		 124 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  37.8 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  38.84 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  49.3 
 
 		 130 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  44.87 
 
 		 132 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  46.48 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  37.61 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  34.82 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  43.53 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  43.53 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  28.43 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  44.16 
 
 		 133 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  44.16 
 
 		 133 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  37.89 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  47.22 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  47.22 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  44.59 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  47.22 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.35 
 
 		 706 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.48 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  39.78 
 
 		 133 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  45.07 
 
 		 134 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.07 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 126 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.3 
 
 		 125 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.3 
 
 		 125 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  45.83 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  40 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  39.02 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.99 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1309  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  39.13 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03393  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 710 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.78 
 
 		 693 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  24.71 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.25 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  39.44 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 734 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  44.44 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3029  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 721 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.25 
 
 		 711 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  39.51 
 
 		 687 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  42.25 
 
 		 734 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1463  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.78 
 
 		 698 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.66 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>