27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0631 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  100 
 
 		 403 aa  811    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  37.12 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  39.23 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  35.98 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  34.48 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.9 
 
 		 272 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  31.1 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.74 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  27.61 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  30.96 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.14 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.63 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.48 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2293  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.85 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  28.77 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  24.52 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  30.37 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.88 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.67 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.57 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.66 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0695  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.38 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  25.28 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0110  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.75 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.548091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4242  hypothetical protein  29.5 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  27.06 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.37 
 
 		 282 aa  46.6  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>