31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1818 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  100 
 
 		 323 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  46.48 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0695  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  41.99 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  42.86 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  34.55 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  35.2 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  31.43 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  34.54 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  35.5 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  33.07 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  31.37 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  42.01 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.53 
 
 		 242 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2293  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  37.08 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.23 
 
 		 272 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.46 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  35.5 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.72 
 
 		 382 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.93 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  37.43 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.71 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1317  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.87 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.88 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.56 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.93 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0276  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.9 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1983  CRISPR-associated Cmr5 family protein  25.93 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.73204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  22.71 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1161  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.85 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.95233  hitchhiker  0.00879473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1287  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.76 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00222199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1114  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.72 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.958745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>