27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1114 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1114  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.958745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1287  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  52.17 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00222199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  43.15 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0276  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  40.16 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1161  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  46.11 
 
 		 170 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.95233  hitchhiker  0.00879473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.15 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  39.88 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  34.76 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  31.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1317  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  36.18 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  27.31 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.13 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  28.4 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  26.07 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  28.49 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.02 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  26.86 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.11 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  26.46 
 
 		 376 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.43 
 
 		 369 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.66 
 
 		 379 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.38 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.72 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.89 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  24.57 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.32 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>